办公室（党委办公室）

主要职责：承担机关日常运转，承担文秘、信息、政务公开、会务、信访、机要保密、档案、督查督办等工作。

法制股

主要职责：组织实施依法行政工作；承担涉及多个税种、社会保险费和非税收入综合性政策文件会办、起草和落实工作；承担规范性文件合法性审查等工作；承担重大执法决定法制审核工作；组织协调重大税务案件审理；承担税务行政复议、行政应讼等工作。

税政股

主要职责：组织实施各税种的征收管理工作，研究制定具体实施办法；指导各税种日常征管、日常检查工作；参与各税种的风险管理和纳税辅导、咨询服务、税收法律救济等工作；组织落实各税种的税收优惠政策；承担增值税发票管理，组织相关信息系统的推广应用及管理。

社会保险费和非税收入股

主要职责：组织实施基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、工伤保险费、生育保险费等社会保险费和文化事业建设费、教育费附加和地方教育附加等有关非税收入征收管理工作。

收入核算股

主要职责：研究拟定本系统税收、社会保险费和有关非税收入的中长期规划，参与拟定税收、社会保险费和有关非税收入预算目标并依法组织实施；拟订出口退（免）税年度安排，组织实施免抵调库年度安排；统筹协调组织收入工作，开展收入预测分析、预警分析和收入质量管理；承担重点税源监控、企业税收资料调查工作；组织落实会统核算、缴库退库、票证管理等制度，实施会计监督；承担税收、社会保险费和有关非税收入票证和各类发票的入库、保管、发送等工作。

纳税服务股

主要职责：组织实施纳税服务工作；承担税法宣传、纳税辅导、咨询服务、办税服务和权益保护等工作。

征收管理股

主要职责：组织落实综合性税收征管法律法规、规章及规范性文件，拟定具体操作办法；组织实施税务登记、纳税申报、普通发票管理等日常征管工作；承担征管质量监控评价；组织实施信息化建设等工作。

税收风险管理股

主要职责：承担信息数据和风险管理的目标规划、制度规定的实施工作；承办上级税务局下发风险应对任务的整合和推送；承担本系统税收风险管理模型构建、分析识别、任务推送、监控评价结果反馈等工作；承担各类税收数据、社会保险费和有关非税收入数据管理和分析应用等事项。

税源管理股

主要职责：承担对所辖税源的监控管理工作，对辖区内纳税人实行分类管理和有效服务。负责所辖纳税人税务登记及纳税申报的调查核实、进行税源预测和分析、重点税源管理跟踪监控、增值税一般纳税人认定管理、减免退税审核调查、日常检查、户籍管理、税源调查等；组织实施各税种纳税评估等工作。

财务管理股

主要职责：组织实施预决算、基建、会计核算、财务内控和政府采购、固定资产等工作。

组织人事股

主要职责：组织实施干部人事制度及人才队伍建设；承担人事、机构编制、干部考核、劳动工资、教育培训；组织开展数字人事推行工作，负责数字人事日常管理等工作。

机关党委（党建工作股）

主要职责：承担机关和派出机构党群工作，宣传和执行党的路线方针政策，承接上级部门开展的巡察工作。

党委纪检组(中共国家税务总局南丹县税务局委员会纪律检查组）

主要职责：负责机关和派出机构党的纪律检查工作。