第一税务分局（重点税源企业税收服务和管理局）

主要职能：组织实施大企业税收服务和管理工作；承担“千户集团”企业名册管理、数据采集、风险应对工作；负责组织、协调、指导、考核本系统大企业税务服务和管理工作。

第二税务分局（车辆购置税征收管理局）

主要职能：组织落实车辆购置税税源管理、纳税评估、纳税服务等工作；协助车辆税收一体化管理工作。

第三税务分局（税收风险管理局）

主要职能：承担信息数据和风险管理等工作；承担各类税收数据、社会保险费和有关非税收入数据的集中管理与分析应用等工作。

稽查局

主要职能：组织落实税务稽查法律法规、规章及规范性文件；统筹本市税务稽查工作；统筹、协调、指导本市税收、社会保险费和有关非税收入检查工作；组织查办督办税收重大违法案件。

第一稽查局

主要职能：负责长洲区、龙圩区、苍梧县、岑溪市区域内税收、社会保险费和有关非税收入违法案件的查处以及查办案件的执行工作。

第二稽查局

主要职能：负责万秀区、梧州高新技术产业区、藤县、蒙山县区域内税收、社会保险费和有关非税收入违法案件的查处以及查办案件的执行工作。