1.办公室(党委办公室)。
主要职责:拟订综合工作制度、年度工作计划,承担机关日常运转,承担文秘、信息、政务公开、会务、信访、机要保密、档案、督查督办等工作
2.法制股。

主要职责:承担依法行政工作;承担涉及多个税种、社会保险费和非税收入综合性政策文件会办、起草和落实工作;承担规范性文件合法性审查等工作;承担重大执法决定法制审核工作;组织协调重大税务案件审理;组织办理税务行政复议、行政诉讼等事项;承担公职律师和法律顾问相关工作;负责本系统内部控制机制工作的组织、管理和监督;组织实施税收执法督察。

3.税政股。

主要职责:组织实施各税种的征收管理工作,研究制定具体实施办法;指导各税种日常征管、日常检查工作;参与各税种的风险管理和纳税辅导、咨询服务、税收法律救济等工作;组织落实各税种的税收优惠政策;承担增值税发票管理,组织相关信息系统的推广应用及管理。

4.社会保险费和非税收入股。

主要职责:组织实施基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、工伤保险费、生育保险费等社会保险费和文化事业建设费、教育费附加和地方教育附加等有关非税收入征收管理工作。

5.收入核算股。

主要职责:研究拟定本系统税收、社会保险费和有关非税收入的中长期规划;拟订出口退(免)税年度安排,组织落实免抵调库年度安排;统筹协调组织收入工作,开展税收收入的预测分析和重点税源监控管理等工作。
6.纳税服务股。
主要职责:组织开展本系统纳税服务工作;组织开展面向纳税人和缴费人的税法宣传、纳税辅导、咨询服务、办税服务和权益保护等工作。
7.征收管理股。
主要职责:组织落实综合性税收征管法律法规、规章及规范性文件;承担税务登记、纳税申报、普通发票管理等征管工作;实施本系统信息化建设等工作。
8.税收风险管理股。
主要职责:承担信息数据和风险管理的目标规划、制度规定的实施工作;承办上级税务局下发风险应对任务的整合和推送;承担本系统税收风险管理模型构建、分析识别、任务推送、监控评价结果反馈等工作。 
9.税源管理股。
主要职责:承担对所辖税源的监控管理工作,对辖区内纳税人实行分类管理和有效服务;承担所辖纳税人税务登记及纳税申报的调查核实、进行税源预测和分析、税源管理跟踪监控、增值税一般纳税人认定管理、减免退税审核调查、日常检查、户籍管理、税源调查、定额核定、催报催缴、数据采集分析、纳税辅导等。
10.财务管理股。
主要职责:组织实施预决算、基建、会计核算、财务内控和政府采购、固定资产等工作。
11.组织人事股。
主要职责:组织实施干部人事制度及人才队伍建设;承担人事、机构编制、干部考核、劳动工资等工作;负责教育培训工作;指导本系统党的组织建设、党员队伍建设等工作。

12.机关党委(党建工作股)。

主要职责:督促各级党组织落实管党治党责任,宣传和执行党的路线方针政策;统筹思想政治建设、意识形态建设、税务文化建设、精神文明建设和统战工作;承接上级部门开展的巡察工作;承担机关和派出机构党群工作。

13.党委纪检组
主要职责:负责机关和派出机构党的纪律检查工作。